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Registros recuperados : 45 | |
1. | | ALVES, A. A.; SALES, R. de O.; NEIVA, J. N. M.; MEDEIROS, A. N.; BRAGA, A. P.; AZEVEDO, D. M. M. R.; SILVA, L. R. F. da. Metabolismo de compostos nitrogenados em ovinos alimentados com dietas contendo vagens de faveira. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, Salvador, v. 12, n. 4, p. 1051-1066, out./dez 2011. 1519-9940 Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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2. | | BARBOSA, P. B. B. M.; VIEIRA, L. da S.; LEITE, A. I.; BRAGA, A. P. Espécies do gênero Eimeria schneider, 1875 (Apicomplexa: eimeriidae) parasitas de caprinos no município de Mossoró, Rio Grande do Norte. Ciência Animal, Fortaleza, v. 13, n. 2, p. 65-72, jul./dez. 2003. Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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3. | | BARRA, P. B.; BRAGA, A. P.; RIBEIRO, H. U.; VASCONCELOS, S. H.; FACUNDES NETO, J. C.; SILVA, A. C. da. Substituicao parcial do farelo de soja pela mistura milho + ureia sobre as caracteristicas de carcaca de caprinos SRD. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL 2.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 8., 2000, Teresina. Resumos... Teresina: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2000. v. 2. p. 334-336. Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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7. | | BRAGA, A. P. A.; SOUZA, L. R. de; LIMA, M. G. F.; CRUZ, J. M.; SOUZA, A. C. Z. de; COSTA, M. S.; CASTRO, V. L. S. S. de; MARIN-MORALES, M. A. The Zebrafish as an Alternative Animal Model for Ecotoxicological Research and Testing Brazilian Archives of Biology and Technology, v. 67, e24220968, 2024. Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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8. | | BRAGA, A. P. A.; VASCONCELLOS, R. L. F.; ROMAGNOLI, E. M.; MELO, I. S. de. Abundância de rizobactérias entre diferentes solos e espécies vegetais do bioma Caatinga. Hechos Microbiológicos, v. 5, n. 2, p. 80, 2014. Suplemento. Edição das Memorias do 22º Congreso Latinoamericano de Microbiologia e 4º Congreso Colombiano de Microbiologia, Cartagena, 2014. Ref. TLP-108. Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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10. | | BRAGA, A. P.; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; CAVALCANTE, F. A.; MESQUISTA, A. Q. de; PINHEIRO, A. K. Características de conformação em bovinos leiteiros no Estado do Acre. In: CONGRESSO REGIONAL DE PESQUISA DO ESTADO DO ACRE, 2.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFAC, 25., 2016, Rio Branco/Cruzeiro do Sul. Inovação: sustentabilidade e desenvolvimento regional: anais. Rio Branco, AC: Edufac, 2016. p. 72. Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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11. | | BRAGA, A. P.; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; CAVALCANTE, F. A.; PINHEIRO, A. K.; SILVA, L. F. da; PASCOAL, S. V.; FERREIRA, A. C. L. Perfil de produção leiteira de pequenas propriedades no estado do Acre. In: CONGRESSO REGIONAL DE PESQUISA DO ESTADO DO ACRE; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFAC, 24., 2015, Rio Branco. Anais... Rio Branco: CNPq: Ufac: Embrapa: Fapac: Ieval, 2015. 1 p. Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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12. | | BRAGA, A. P.; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; DANTAS, F. L.; PINHEIRO, A. K.; SILVA, M. S. Efeito da sazonalidade da produção de leite no fornecimento de um laticínio no Estado do Acre. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE PECUÁRIA LEITEIRA DA AMAZÔNIA OCIDENTAL, 1., 2019, Rio Branco, AC. Anais... Rio Branco, AC: Edufac, 2019. p. 58. Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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13. | | BRAGA, A. P.; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; DANTAS, F. L.; PINHEIRO, A. K.; SILVA, M. S. Ocorrência de leite ácido e adição de água em leite cru entregue em laticínio no estado do Acre. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE PECUÁRIA LEITEIRA DA AMAZÔNIA OCIDENTAL, 1., 2019, Rio Branco, AC. Anais... Rio Branco, AC: Edufac, 2019. p. 73. Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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14. | | BRAGA, A. P.; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; PINHEIRO, A. K. Peso a desmama de bezerros Nelore em propriedades comerciais com sistema de cria, recria e engorda. In: SIMPÓSIO SOBRE SANIDADE E PRODUÇÃO ANIMAL, 4., 2017, Rio Branco, AC. Anais... Rio Branco, AC: Ufac, 2017. p. 55. Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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16. | | BRAGA, A. P.; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; ROSA, A. do N.; PINHEIRO, A. K.; SILVA, M. S. Efeitos de ambiente na definição de valor de touros Nelore comercializados em leilões no Brasil. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 5., 2022, Rio Branco, AC. O papel da tecnologia agrícola na segurança alimentar: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2023. p. 135-141. Pôster. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 5). Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau. Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Gado de Corte. |
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18. | | BRAGA, A. P.; RIBEIRO, H. U.; BARRA, P. B.; BARRA, S. B.; VASCONCELOS, S. H. L.; BRAGA, Z. C. A. da C. Composição químico-bromatológica das silagens de capim-elefante cv. Cameron em cinco idades de corte. Caatinga, Mossoró, v. 14, n. 1/2, p. 17-23, dez. 2001. p. 17-23. Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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19. | | BRAGA, Z. C. A. da C.; BRAGA, A. P.; RANGEL, A. H. do N.; AGUIAR, E. M. de; LIMA JÚNIOR, D. M. de. Avaliação do consumo e digestibilidade aparente de rações com diferentes níveis de farelo de coco. Caatinga, Mossoró, v. 22, n. 1, p. 249-256, jan./mar. 2009. Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Registros recuperados : 45 | |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
03/01/2018 |
Data da última atualização: |
11/01/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 2 |
Autoria: |
NASCIMENTO, M.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; CRUZ, C. D.; NASCIMENTO, A. C. C.; VIANA, J. M. S.; AZEVEDO, C. F.; BARROSO, L. M. A. |
Afiliação: |
M. Nascimento, UFV; F. F. e Silva, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; C. D. Cruz, UFV; A. C. C. Nascimento, UFV; J. M. S. Viana, UFV; C. F. Azevedo, UFV; L. M. A. Barroso, UFV. |
Título: |
Regularized quantile regression applied to genome-enabled prediction of quantitative traits. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 16, n. 1, gmr16019538, 2017. |
Páginas: |
12 p. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Genomic selection (GS) is a variant of marker-assisted selection, in which genetic markers covering the whole genome predict individual genetic merits for breeding. GS increases the accuracy of breeding values (BV) prediction. Although a variety of statistical models have been proposed to estimate BV in GS, few methodologies have examined statistical challenges based on non-normal phenotypic distributions, e.g., skewed distributions. Traditional GS models estimate changes in the phenotype distribution mean, i.e., the function is defined for the expected value of trait-conditional on markers, E(Y|X). We proposed an approach based on regularized quantile regression (RQR) for GS to improve the estimation of marker effects and the consequent genomic estimated BV (GEBV). The RQR model is based on conditional quantiles, Qt(Y|X), enabling models that fit all portions of a trait probability distribution. This allows RQR to choose one quantile function that ?best? represents the relationship between the dependent and independent variables. Data were simulated for 1000 individuals. The genome included 1500 markers; most had a small effect and only a few markers with a sizable effect were simulated. We evaluated three scenarios according to symmetrical, positively, and negatively skewed distributions. Analyses were performed using Bayesian LASSO (BLASSO) and RQR considering three quantiles (0.25, 0.50, and 0.75). The use of RQR to estimate GEBV was efficient; the RQR method achieved better results than BLASSO, at least for one quantile model fit for all evaluated scenarios. The gains in relation to BLASSO were 86.28 and 55.70% for positively and negatively skewed distributions, respectively. MenosGenomic selection (GS) is a variant of marker-assisted selection, in which genetic markers covering the whole genome predict individual genetic merits for breeding. GS increases the accuracy of breeding values (BV) prediction. Although a variety of statistical models have been proposed to estimate BV in GS, few methodologies have examined statistical challenges based on non-normal phenotypic distributions, e.g., skewed distributions. Traditional GS models estimate changes in the phenotype distribution mean, i.e., the function is defined for the expected value of trait-conditional on markers, E(Y|X). We proposed an approach based on regularized quantile regression (RQR) for GS to improve the estimation of marker effects and the consequent genomic estimated BV (GEBV). The RQR model is based on conditional quantiles, Qt(Y|X), enabling models that fit all portions of a trait probability distribution. This allows RQR to choose one quantile function that ?best? represents the relationship between the dependent and independent variables. Data were simulated for 1000 individuals. The genome included 1500 markers; most had a small effect and only a few markers with a sizable effect were simulated. We evaluated three scenarios according to symmetrical, positively, and negatively skewed distributions. Analyses were performed using Bayesian LASSO (BLASSO) and RQR considering three quantiles (0.25, 0.50, and 0.75). The use of RQR to estimate GEBV was efficient; the RQR method achieved be... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Genomic selection; Regularized regression; Seleção genômica; SNP effects. |
Thesagro: |
Estatística. |
Thesaurus NAL: |
Marker-assisted selection; Simulation models; Statistics. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/170209/1/2017-M.Deon-GMR-Regularized.pdf
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Marc: |
LEADER 02634naa a2200313 a 4500 001 2084109 005 2018-01-11 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aNASCIMENTO, M. 245 $aRegularized quantile regression applied to genome-enabled prediction of quantitative traits.$h[electronic resource] 260 $c2017 300 $a12 p. 520 $aGenomic selection (GS) is a variant of marker-assisted selection, in which genetic markers covering the whole genome predict individual genetic merits for breeding. GS increases the accuracy of breeding values (BV) prediction. Although a variety of statistical models have been proposed to estimate BV in GS, few methodologies have examined statistical challenges based on non-normal phenotypic distributions, e.g., skewed distributions. Traditional GS models estimate changes in the phenotype distribution mean, i.e., the function is defined for the expected value of trait-conditional on markers, E(Y|X). We proposed an approach based on regularized quantile regression (RQR) for GS to improve the estimation of marker effects and the consequent genomic estimated BV (GEBV). The RQR model is based on conditional quantiles, Qt(Y|X), enabling models that fit all portions of a trait probability distribution. This allows RQR to choose one quantile function that ?best? represents the relationship between the dependent and independent variables. Data were simulated for 1000 individuals. The genome included 1500 markers; most had a small effect and only a few markers with a sizable effect were simulated. We evaluated three scenarios according to symmetrical, positively, and negatively skewed distributions. Analyses were performed using Bayesian LASSO (BLASSO) and RQR considering three quantiles (0.25, 0.50, and 0.75). The use of RQR to estimate GEBV was efficient; the RQR method achieved better results than BLASSO, at least for one quantile model fit for all evaluated scenarios. The gains in relation to BLASSO were 86.28 and 55.70% for positively and negatively skewed distributions, respectively. 650 $aMarker-assisted selection 650 $aSimulation models 650 $aStatistics 650 $aEstatística 653 $aGenomic selection 653 $aRegularized regression 653 $aSeleção genômica 653 $aSNP effects 700 1 $aSILVA, F. F. e 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aCRUZ, C. D. 700 1 $aNASCIMENTO, A. C. C. 700 1 $aVIANA, J. M. S. 700 1 $aAZEVEDO, C. F. 700 1 $aBARROSO, L. M. A. 773 $tGenetics and Molecular Research$gv. 16, n. 1, gmr16019538, 2017.
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